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高通量二代基因测序仪(2023.6)
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2023-08-18发布 60页 文档编号:202308180000726909 需下载券:10
高通量二代基因测序仪(2023.6)

采购内容

一、(根据本项目实际情况,填写“采购标的”或“项目概况”)

本次采购的产品高通量二代基因测序仪为核心产品(须在投标文件中注明具体的品牌)。

核心产品相关要求详见采购文件第二章。

二、技术要求

(一)主要设备技术参数

1.通量:两种规格芯片,大芯片单次运行最高可产出≥150G碱基数据:小芯片单次运行最高可产出≥23G碱基数据。

▲2.序列数目:大芯片单次运行生成≥500M reads;小芯片单次运行生成≥75M reads。

3.光学系统:能识别的间距≤715纳米。

4.单端读取序列和双端读取序列两种模式。

5.样本标签序列≥9个碱基(bp),可提高样本识别的精确度。

6.可精确读取≥12个连续单个重复碱基。

★7.测序过程中无需PCR环节。

8.设备应支持多种序列读长包括:SE50、SE100、PE50、PE100、PE150模式的读长检测。

9.准确率:PE100读长模式下,数据高于Q30>85%。

10.运行时间:在SE100模式下单次运行时间≤10小时,包括:样本加载、测序、碱基识别和数据处理时间。

11.仪器集成度:高度集成化,无需芯片前处理系统,无需借助其他设备即可独立完成测序过程。

★12.测序原理:采取领先的测序核心技术:联合探针锚定聚合技术和DNA纳米球测序技术。须提供产品彩页或检测报告进行佐证,检测报告须体现“CMA"标识。

▲13.芯片:采用规则阵列技术,具有密度大,避免荧光信号交叉影响,并提供产品彩页或检测报告进行佐证,检测报告须体现“CMA"标识。

14.信息分析:自动本地化完成信息分析,分析结束后直接输出检测报告。测序的同时能进行初步数据分析,并产生有质量打分的碱基序列。

15.芯片上每一个测序信号单元均由原始DNA链耦合扩增出来的,可避免指数扩增带来错误累积。

16.设备采用芯片无需液态介质储存及使用。

17.系统控制软件:须提供中文系统,可实现中英文双语控制系统切换。

18.生信分析软件

18.1.包含带分析流程的微生物数据库,数据库中包含了细菌、真菌、病毒、寄生虫等病原微生物。目前一次可鉴定≥25256种微生物。数据库中共包括≥25256种微生物,其中≥8717种病毒、≥8521种真菌、≥7098种细菌、≥305种古生菌及≥615种寄生虫。数据库会定期更新,确保数据库的信息时效性。

▲18.2数据库:除人源参考序列外,还内置了猪、山羊、绵羊、小鼠、大鼠、鲤鱼、家鹅、鸡、鸭、牛、猫、狗、兔等常见动物的参考序列,可实现自动过滤此类宿主信息,亦可根据客户需求定制。

18.3可从宏基因组或宏转录组水平上对原始样本中的微生物核酸序列进行快速、准确、全面的鉴定,并自动生成鉴定报告及分析结果。

▲18.4包含实验室信息管理系统,从样本制备到分析报告,端到端的全流程解决方案。

18.5基因组组装模块和未知病原模块:对细菌、真菌、病毒的WGS测序数据进行质控、有参组装和无参组装、基因预测、泛基因组和核心基因组分析、物种进化等分析。所有样品的报告展示了所有样品的分析结果,包括质控结果、组装结果以及进化分析的结果。

18.6宏基因组模块和致病菌模块:提供DNA/RNA按照细菌、病毒、古生菌、真菌和寄生虫的鉴定表格和相对丰度信息;同时进行DNA和RNA分析的样本,还提供RNA vs DNA的物种活跃度结果;可提示毒力基因鉴定结果;耐药基因鉴定结果。软件系统6小时内完成病原快速鉴定报告及鉴定结果文件,报告自动生成。

18.7流感模块:高通量测序的检测方法无需对流感病毒进行分离培养,无需预先区分甲型、乙型流感,可直接对培养毒株、咽拭子、肺泡灌洗液等样本类型检测开展测序,获得所有流感病毒亚型全基因组序列,一次性完成不同型别流感病毒的识别、追踪和溯源。同时兼顾数据量需求少,检测通量大,检测成本低等优点。

18.8 HIV-1模块:覆盖从样本到结果全流程,对HIV-1进行快速、准确地测序,实现HIV-1的耐药分析,基因组组装和进化溯源,为艾滋病的耐药监测提供支撑,为艾滋病的进化研究提供工具。

18.9新冠模块:专为新冠设计的软件,可进行宏基因组或者多重PCR打断技术测序数据的分析。包含数据质控、组装、变异注释、分型、溯源功能。

(二)仪器配置要求

1.高通量二代基因测序仪

1.1主机:1台

1.2内置软件:1套

2.生信分析软件

2.1未知病原生物鉴定和宏基因组模块,1套;

2.2致病菌组装溯源模块,1套;

2.3新冠病毒模块,1套;

2.4流感病毒模块,1套;

2.5 HIV全基因组测序和耐药分析模块,1套

2.6数据分析服务器:1套

CPU:Intel Xeon Gold 6240*2;内存:192GB DDR4,固态硬盘:2TB+250GB,机械硬盘:30TB。

3.其他配套设施

3.1高强度磁力架

最佳工作体积:10–2,000 ul。可以放置≥16个标准的1.5-2ml微量离心管。上部的试管架可快速从基座内的磁体上取下,以便进行重悬、涡旋混合或样品的手动振荡

3.2生化培养箱(100L)

控温范围:5℃-65℃,容积≥100 L,无氟制冷,不锈钢内胆,箱内搁板间距可调,带定时功能,有独立限温报警系统。

3.3移液器1套

1)连续可调1-10ul,10-50ul,20-200ul,100-1000ul各1支;

2)吸头连杆及相关组件可进行高温高压灭菌,并可整支紫外线灭菌。

3.4试剂及耗材

所用产品均为国产商品,并提供用于装机培训的配套建库与测序用的试剂1套,用于未知病原和宏基因组检测。

三、商务条件

采购包1:

序号

参数性质

类型

要求

1

交货时间

自合同签订之日起30日

2

交货地点

福建省龙岩市疾病预防控制中心

3

交货条件

项目验收合格

4

是否邀请投标人验收

不邀请投标人验收

5

履约验收方式

1、期次1,说明:验收标准:1.根据本采购文件、响应文件及有关国家、行业规定进行验收。2.供应商提供的货物制造标准、安装标准及技术规范等,必须符合最新国家标准的要求。各项技术标准应当符合国家强制性标准。3、根据采购要求进行产品安装、调试、测试、试运行后,由采购人或采购人请技术专家检测作为验收标准依据并组织进行使用性能方面的验收,所需检测费用包含在总报价中。4、货物到货验收时供应商必须在场,并提供产品合格证、质量保证文件等相关证明材料。

6

合同支付方式

1、项目最终验收合格(付款前成交供应商应开具合同全额发票),达到付款条件起15日内,支付合同总金额的100.00%

其他商务要求:

1.磋商供应商应提供全套、完整的技术资料(中文版),包括仪器说明书、操作手册、维护保养说明等。

2.磋商供应商成交提供最新版的生信分析软件,终生免费升级所购买各模块数据库,以满足不断更新的病毒基因组数据库。

3.仪器安装、调试、检定:仪器到达最终用户现场后,磋商供应商成交提供安装条件、用水、用电条件说明。实验室条件合格后,磋商供应商成交在接到用户通知后需安排有经验的工程技术人员到用户现场安装、调试仪器,设备安装调试需在7日内完成。

4.培训要求:安装调试完成后,磋商供应商成交应免费提供仪器操作和日常维护的现场培训,包括但不限于仪器原理、使用方法和维护保养方法等;免费培训操作人员至少5名,直至被培训人员熟练操作设备为止,并提供培训合格证书。

5.仪器生产厂家需设有售后服务中心(可在响应文件中提供资质证明,包括售后服务中心营业执照和工程师名单、联系方法等)

6.仪器验收:以上5项满足后,完成仪器验收。

质量保证

保修期:主机及相关配套设备保修期1年,自设备验收合格之日起计算。保修期内提供免费保修。生化培养箱到货后由第三方校准后,出具校准证书一份。移液器到货前由第三方机构检定合格后,出具检定证书一份。

厂家售后服务体系

1.能够提供快速的安装调试,操作指导和维修等方面的技术服务。

2.拥有客户应用支持中心,为基层客户提供仪器使用和应用支持,为用户提供分析咨询演示分析和培训等服务。

3.具备完善的零备件供应体系,方便客户购买消耗品和零备件。

4.售后服务中心提供设备终身维修,维修响应时间为24小时内,48小时内到达现场,72小时内修复;72小时内无法修复的,成交供应商应提供相应配置的代用设备或更换新设备,以保证使用单位工作生产不中断,其中发生一切费用由成交供应商承担。特殊情况下,由成交供应商与使用单位协商,并经使用单位同意后在双方约定的时间内完成设备的修复或更换。质保期满后,成交供应商负责终身维护,使用单位只需付零配件费用(零配件按市场批发价提供)。

四、其他事项

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